iDeCoの年末調整・確定申告｜控除証明書と手続き

会社員：個人払込なら年末調整

本人名義の口座からiDeCo掛金を支払う「個人払込」の会社員は、国民年金基金連合会が発行する小規模企業共済等掛金払込証明書に記載された年間掛金額を、給与所得者の保険料控除申告書の「小規模企業共済等掛金控除（個人型年金加入者掛金）」欄に記入します。

事業主払込なら原則個人手続き不要

給与天引きの「事業主払込」の第2号加入者は、勤務先が給与計算の際にiDeCo掛金を控除して源泉徴収税額を計算します。この場合、本人向けの小規模企業共済等掛金払込証明書は発行されず、年末調整も勤務先が把握している納付済掛金額に基づいて行います。

控除証明書が年末調整に間に合わない場合

iDeCo公式は追加発行を例年11月下旬・12月下旬・翌1月下旬に行うと案内しています。たとえば10月に初回払込実績がある場合や、10月発行時点の払込金額・払込予定金額に変更が生じた場合は追加発行の対象になり得ます。勤務先の年末調整期限に間に合わなければ、翌年の確定申告で小規模企業共済等掛金控除を申告します。

自営業・年末調整しない人は確定申告

確定申告では、その年に支払ったiDeCo掛金を小規模企業共済等掛金控除欄に記入します。国税庁は、証明書または一定の電子証明書等を添付・提示する方法を案内しています。

令和8年分以後の所得税について、令和9年1月1日以後に提出する確定申告では、一定事項を記載した明細書を添付することで、証明書の添付・提示に代えられる制度もあります。

よくあるミス

• iDeCoを生命保険料控除欄に書く → 小規模企業共済等掛金控除です。
• 掛金の一部だけ控除対象と思う → その年に支払った対象掛金は全額控除。
• 事業主払込なのに証明書を探す → 原則発行されません。
• 年末調整を逃したら控除不可と思う → 確定申告で申告できます。

節税額の目安はiDeCoはいくら節税できる？で確認できます。